Aunque los probióticos se consideran beneficiosos para la salud, para algunas personas, la ingestión inicial de estos microorganismos puede provocar una serie de síntomas incómodos. Cuando toman probióticos por primera vez, algunas personas pueden experimentar síntomas como hinchazón, diarrea, dolores de cabeza, fiebre, dolor muscular, confusión mental y posiblemente ansiedad. Se cree que estos síntomas son una respuesta a cambios que ocurren en el cuerpo, como la desaparición de patógenos potenciales o la reactivación de respuestas intestinales, un fenómeno a veces denominado "reacción de Herxheimer".
La reacción de Herxheimer es una respuesta inicial que suele indicar que el cuerpo se está adaptando a un nuevo entorno microbiano. Esto puede deberse a que los probióticos interactúan con la comunidad microbiana existente, provocando la muerte de las bacterias o la liberación de metabolitos que desencadenan estos síntomas. Aunque es incómoda, esta reacción suele ser de corta duración y desaparece rápidamente. Se puede considerar como parte del proceso de homeostasis del cuerpo.

Por lo general, esto afecta solo a un pequeño número de personas, los síntomas son leves y generalmente duran solo de unos pocos días a algunas semanas. Si estos síntomas le incomodan, puede reducir la dosis o dejar de usarlo durante unos días antes de volver a intentarlo; si estos síntomas persisten durante más de unas pocas semanas, deje de usarlo; Si tiene dificultad para respirar, opresión en la garganta, urticaria u otros síntomas de reacciones alérgicas, deje de usarlo inmediatamente. Para reducir la posibilidad de efectos secundarios, especialmente en personas con sistemas digestivos sensibles, es aconsejable comenzar con una pequeña cantidad de probióticos y luego aumentar la dosis durante algunas semanas.
Los probióticos deben utilizarse con especial precaución en personas con deficiencias inmunitarias graves, ya que, en casos raros, la ingestión de probióticos puede provocar una infección. Esto se debe a que el sistema inmunológico no puede controlar eficazmente la proliferación de microorganismos en el cuerpo, provocando el riesgo de infección.
Algunas personas pueden tener reacciones alérgicas a ciertos tipos de probióticos, especialmente a las levaduras relacionadas con Saccharomyces boulardii. Otros tipos de probióticos, como los lactobacilos, generalmente no provocan reacciones alérgicas.
Algunos probióticos pueden producir histamina en el tracto digestivo. La liberación excesiva de histamina puede causar síntomas como picazón, aumento de la producción de lágrimas, secreción nasal, dificultad para respirar, enrojecimiento e hinchazón, especialmente en personas con intolerancia a la histamina. Evite estas cepas probióticas para prevenir molestias.





